Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Phka1P18826 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phka1P18826 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phka1P18826 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phka1P18826 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phka1P18826 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phka1P18826 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phka1P18826 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phka1P18826 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms