Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmga1P17095 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hmga1P17095 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmga1P17095 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmga1P17095 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmga1P17095 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmga1P17095 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmga1P17095 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmga1P17095 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmga1P17095 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmga1P17095 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmga1P17095 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hmga1P17095 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmga1P17095 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmga1P17095 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmga1P17095 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmga1P17095 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmga1P17095 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmga1P17095 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmga1P17095 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmga1P17095 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmga1P17095 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmga1P17095 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmga1P17095 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmga1P17095 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmga1P17095 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmga1P17095 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmga1P17095 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmga1P17095 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmga1P17095 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmga1P17095 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms