Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msh3P13705 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh3P13705 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msh3P13705 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh3P13705 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Msh3P13705 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh3P13705 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh3P13705 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msh3P13705 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms