Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd5P13379 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd5P13379 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd5P13379 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd5P13379 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd5P13379 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd5P13379 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms