Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prf1P10820 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prf1P10820 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prf1P10820 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prf1P10820 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prf1P10820 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prf1P10820 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prf1P10820 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prf1P10820 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prf1P10820 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prf1P10820 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prf1P10820 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prf1P10820 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prf1P10820 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prf1P10820 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prf1P10820 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms