Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI2P10070 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI2P10070 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI2P10070 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI2P10070 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI2P10070 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI2P10070 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI2P10070 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GLI2P10070 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GLI2P10070 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GLI2P10070 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GLI2P10070 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GLI2P10070 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
GLI2P10070 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI2P10070 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI2P10070 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI2P10070 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GLI2P10070 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
GLI2P10070 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GLI2P10070 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GLI2P10070 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GLI2P10070 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GLI2P10070 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GLI2P10070 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GLI2P10070 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GLI2P10070 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GLI2P10070 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GLI2P10070 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GLI2P10070 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GLI2P10070 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GLI2P10070 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GLI2P10070 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GLI2P10070 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
GLI2P10070 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GLI2P10070 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GLI2P10070 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GLI2P10070 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
GLI2P10070 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI2P10070 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI2P10070 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI2P10070 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI2P10070 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI2P10070 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI2P10070 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GLI2P10070 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
GLI2P10070 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
GLI2P10070 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GLI2P10070 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GLI2P10070 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
GLI2P10070 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GLI2P10070 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GLI2P10070 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GLI2P10070 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GLI2P10070 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GLI2P10070 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI2P10070 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI2P10070 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI2P10070 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI2P10070 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
GLI2P10070 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
GLI2P10070 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GLI2P10070 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GLI2P10070 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GLI2P10070 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI2P10070 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI2P10070 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI2P10070 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI2P10070 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI2P10070 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI2P10070 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI2P10070 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GLI2P10070 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GLI2P10070 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
GLI2P10070 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GLI2P10070 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
GLI2P10070 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GLI2P10070 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GLI2P10070 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GLI2P10070 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms