Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2BP0DMW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMIM10L2BP0DMW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2BP0DMW5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms