Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00271P0C7V0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00271P0C7V0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms