Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr2aP08775 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr2aP08775 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2aP08775 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2aP08775 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms