Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP3P08254 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP3P08254 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP3P08254 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP3P08254 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP3P08254 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP3P08254 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP3P08254 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP3P08254 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP3P08254 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP3P08254 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMP3P08254 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP3P08254 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP3P08254 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP3P08254 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP3P08254 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP3P08254 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP3P08254 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP3P08254 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP3P08254 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP3P08254 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP3P08254 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP3P08254 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP3P08254 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP3P08254 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP3P08254 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP3P08254 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP3P08254 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP3P08254 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP3P08254 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP3P08254 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP3P08254 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMP3P08254 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP3P08254 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP3P08254 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP3P08254 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP3P08254 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP3P08254 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP3P08254 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP3P08254 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms