Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOCP08134 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOCP08134 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHOCP08134 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHOCP08134 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RHOCP08134 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOCP08134 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOCP08134 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOCP08134 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOCP08134 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOCP08134 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOCP08134 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOCP08134 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOCP08134 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOCP08134 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOCP08134 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOCP08134 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOCP08134 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOCP08134 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOCP08134 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOCP08134 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOCP08134 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOCP08134 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOCP08134 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOCP08134 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOCP08134 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOCP08134 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOCP08134 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOCP08134 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOCP08134 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOCP08134 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOCP08134 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOCP08134 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOCP08134 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOCP08134 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOCP08134 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOCP08134 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOCP08134 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms