Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB1P08034 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB1P08034 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB1P08034 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB1P08034 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB1P08034 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB1P08034 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB1P08034 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB1P08034 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB1P08034 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB1P08034 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB1P08034 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJB1P08034 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB1P08034 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB1P08034 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB1P08034 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB1P08034 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB1P08034 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB1P08034 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB1P08034 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB1P08034 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB1P08034 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB1P08034 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB1P08034 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB1P08034 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB1P08034 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB1P08034 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB1P08034 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB1P08034 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB1P08034 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB1P08034 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB1P08034 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB1P08034 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms