Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01797 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01797 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P01797 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01797 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01797 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01797 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01797 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01797 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01797 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
P01797 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01797 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01797 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01797 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01797 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01797 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01797 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01797 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01797 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01797 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01797 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01797 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01797 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01797 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01797 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P01797 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01797 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01797 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01797 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01797 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01797 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01797 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01797 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms