Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01739 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01739 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01739 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01739 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01739 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01739 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01739 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01739 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01739 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01739 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01739 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms