Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01725 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01725 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01725 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01725 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01725 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01725 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01725 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01725 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01725 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01725 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01725 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01725 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01725 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01725 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01725 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01725 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01725 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01725 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01725 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01725 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01725 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01725 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01725 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01725 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01725 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01725 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01725 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01725 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01725 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01725 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01725 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01725 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01725 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01725 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01725 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01725 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01725 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01725 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms