Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB6O95452 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB6O95452 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB6O95452 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB6O95452 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB6O95452 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB6O95452 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB6O95452 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB6O95452 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB6O95452 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB6O95452 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB6O95452 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB6O95452 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB6O95452 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB6O95452 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB6O95452 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB6O95452 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB6O95452 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB6O95452 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB6O95452 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB6O95452 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB6O95452 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB6O95452 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB6O95452 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB6O95452 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB6O95452 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB6O95452 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB6O95452 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB6O95452 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB6O95452 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB6O95452 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB6O95452 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB6O95452 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB6O95452 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB6O95452 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB6O95452 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB6O95452 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB6O95452 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB6O95452 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB6O95452 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB6O95452 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB6O95452 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB6O95452 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB6O95452 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB6O95452 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB6O95452 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJB6O95452 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB6O95452 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB6O95452 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB6O95452 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB6O95452 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB6O95452 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB6O95452 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB6O95452 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB6O95452 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms