Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5LO95447 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms