Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Orc4O88708 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Orc4O88708 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Orc4O88708 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Orc4O88708 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Orc4O88708 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Orc4O88708 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Orc4O88708 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Orc4O88708 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Orc4O88708 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Orc4O88708 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Orc4O88708 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Orc4O88708 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Orc4O88708 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Orc4O88708 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Orc4O88708 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms