Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnmt3bO88509 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dnmt3bO88509 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms