Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sorl1O88307 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms