Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIN3BO75182 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIN3BO75182 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIN3BO75182 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms