Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TsksO54887 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TsksO54887 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TsksO54887 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TsksO54887 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TsksO54887 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TsksO54887 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TsksO54887 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TsksO54887 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TsksO54887 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TsksO54887 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TsksO54887 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TsksO54887 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TsksO54887 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TsksO54887 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TsksO54887 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TsksO54887 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TsksO54887 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TsksO54887 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TsksO54887 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TsksO54887 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TsksO54887 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TsksO54887 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TsksO54887 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TsksO54887 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TsksO54887 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TsksO54887 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TsksO54887 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TsksO54887 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TsksO54887 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TsksO54887 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TsksO54887 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TsksO54887 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TsksO54887 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TsksO54887 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TsksO54887 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TsksO54887 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TsksO54887 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TsksO54887 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TsksO54887 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TsksO54887 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TsksO54887 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TsksO54887 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TsksO54887 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TsksO54887 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TsksO54887 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TsksO54887 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TsksO54887 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TsksO54887 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TsksO54887 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TsksO54887 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TsksO54887 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TsksO54887 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TsksO54887 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TsksO54887 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TsksO54887 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TsksO54887 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms