Protein–RNA interactions for Protein: O54834

Arhgap6, Rho GTPase-activating protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap6O54834 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap6O54834 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arhgap6O54834 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap6O54834 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms