Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITM2AO43736 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITM2AO43736 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms