Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC11O43248 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms