Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf5O35445 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf5O35445 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms