Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kpna6O35345 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kpna6O35345 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kpna6O35345 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms