Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf5O35326 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf5O35326 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf5O35326 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf5O35326 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf5O35326 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf5O35326 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf5O35326 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf5O35326 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf5O35326 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms