Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rundc3aO08576 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms