Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm11236J3QMS7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm11236J3QMS7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm11236J3QMS7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms