Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm20828J3KMI7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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Gm20828J3KMI7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Gm20828J3KMI7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Gm20828J3KMI7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Gm20828J3KMI7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Gm20828J3KMI7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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