Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zc3h12bG3X9I7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Zc3h12bG3X9I7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h12bG3X9I7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms