Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
2610008E11RikG3X964 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
2610008E11RikG3X964 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610008E11RikG3X964 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms