Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20509G3UZF1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20509G3UZF1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20509G3UZF1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms