Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ercc6F8VPZ5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Ercc6F8VPZ5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ercc6F8VPZ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ercc6F8VPZ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ercc6F8VPZ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.7 ms