Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8220F6YKI2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms