Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933403O08RikF6UK53 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms