Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf212F6TQD1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms