Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Raph1F2Z3U3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Raph1F2Z3U3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Raph1F2Z3U3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Raph1F2Z3U3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Raph1F2Z3U3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Raph1F2Z3U3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Raph1F2Z3U3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Raph1F2Z3U3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms