Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh18E9Q9Q6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh18E9Q9Q6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms