Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc146E9Q9F7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc146E9Q9F7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc146E9Q9F7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms