Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col22a1E9Q7P1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col22a1E9Q7P1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Col22a1E9Q7P1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col22a1E9Q7P1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms