Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4H3

Vmn1r119, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r119E9Q4H3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vmn1r119E9Q4H3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vmn1r119E9Q4H3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vmn1r119E9Q4H3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vmn1r119E9Q4H3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vmn1r119E9Q4H3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vmn1r119E9Q4H3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vmn1r119E9Q4H3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r119E9Q4H3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r119E9Q4H3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r119E9Q4H3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r119E9Q4H3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.4 ms