Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Trappc8E9PWG2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Trappc8E9PWG2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Trappc8E9PWG2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms