Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3252E9PUT9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3252E9PUT9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3252E9PUT9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms