Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROB1E7EW31 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROB1E7EW31 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms