Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Soga1E1U8D0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Soga1E1U8D0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Soga1E1U8D0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Soga1E1U8D0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms