Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp6ap1lD3Z5W0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms