Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim12cD3Z3L3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim12cD3Z3L3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.6 ms