Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700015F17RikD3YUK8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700015F17RikD3YUK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700015F17RikD3YUK8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms